Executar junção em consultas combinadas

seu método atual não é muito eficiente. Outros geralmente usarão CASE WHEN para fazê-lo.

SELECT   t.uniqueID,
         IN_Info1 = MAX(case when t.type = 'IN' then t.information1 end),
         IN_Info2 = MAX(case when t.type = 'IN' then t.information2 end),
         IN_Notes = MAX(case when t.type = 'IN' then t.Notes end),
         OUT_Info1 = MAX(case when t.type = 'OUT' then t.information1 end),
         OUT_Info2 = MAX(case when t.type = 'OUT' then t.information2 end),
         OUT_Notes = MAX(case when t.type = 'OUT' then t.Notes end)
FROM     TABLEB t
GROUP BY t.uniqueID

e, em seguida, para incorporar em sua grande consulta, você pode usar CTE ou DERIVED TABLE

-- CTE
; with Tblb as
(
  SELECT   t.uniqueID,
           IN_Info1 = MAX(case when t.type = 'IN' then t.information1 end),
           IN_Info2 = MAX(case when t.type = 'IN' then t.information2 end),
           IN_Notes = MAX(case when t.type = 'IN' then t.Notes end),
           OUT_Info1 = MAX(case when t.type = 'OUT' then t.information1 end),  
           OUT_Info2 = MAX(case when t.type = 'OUT' then t.information2 end),  
           OUT_Notes = MAX(case when t.type = 'OUT' then t.Notes end)
  FROM     TABLEB t
  GROUP BY t.uniqueID
)
select   *
from     TableA a
         inner join Tblb b ON a.uniqueID = b.uniqueID

Você não pode fazer isso X1.t1.uniqueID. , deve ser apenas X1.uniqueID