É porque o xampp usa um
alias para apontar https://localhost/phpmyadmin para xampp's phpmyadmin path Então o que você pode fazer é encontrar
Alias /phpmyadmin em seu httpd.conf e substitua-o por Alias /xphpmyadmin ou mesmo Alias /phpmyadmin2 . Se você fizer isso, você não terá conflito em ter um phpmyadmin pasta em seu webs pasta.