Se, mesmo após o upload repetido, você ainda receber um erro de tempo limite, altere suas configurações em

\phpmyadmin\libraries\config.default.php

from $cfg['ExecTimeLimit'] = 300; para $cfg['ExecTimeLimit'] = 0; e reinicie. Agora não há limite de tempo de execução (confiamos que estamos falando de servidor local).

Fonte:Alterar tempo limite do script no phpmyadmin