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Agregação do Mongodb por dia e depois por hora


O que você basicamente quer é um agrupamento duplo, mas você não obtém todo o objeto de data de volta usando o operadores de agregação de data , apenas as partes relevantes:
db.collection.aggregate([
    { "$group": {
        "_id": {
            "customerId": "$customerId",
            "day": { "$dayOfYear": "$startTime" },
            "hour": { "$hour": "$startTime" }
        },
        "pings": { "$sum": "$ping" },
        "links": { "$sum": "$link" }
    }},
    { "$group": {
       "_id": {
           "customerId": "$_id.customerId",
           "day": "$_id.day"
       },
       "hours": { 
           "$push": { 
               "hour": "$_id.hour",
               "pings": "$pings",
               "links": "$links"
           }
       }
    }}
])

O duplo $group fornece o formato desejado, colocando os resultados em uma matriz por dia. Documento único na amostra, mas você basicamente obtém resultados como este:
{
    "_id" : {
            "customerId" : 123,
            "day" : 365
    },
    "hours" : [
            {
                    "hour" : 10,
                    "pings" : 2,
                    "links" : 3
            }
    ]
}

Se você achar os resultados dos operadores de data difíceis de lidar ou quiser um resultado de "passagem" simplificado para objetos de data, poderá converter como carimbos de data e hora de época:
db.collection.aggregate([
    { "$group": {
        "_id": {
            "customerId": "$customerId",
            "day": {
               "$subtract": [
                   { "$subtract": [ "$startTime", new Date("1970-01-01") ] },
                   {
                       "$mod": [
                           { "$subtract": [ "$startTime", new Date("1970-01-01") ] },
                           1000*60*60*24   
                       ]
                   }
               ]
            },
            "hour": {
               "$subtract": [
                   { "$subtract": [ "$startTime", new Date("1970-01-01") ] },
                   {
                       "$mod": [
                           { "$subtract": [ "$startTime", new Date("1970-01-01") ] },
                           1000*60*60   
                       ]
                   }
               ]
            }
        },
        "pings": { "$sum": "$ping" },
        "links": { "$sum": "$link" }
    }},
    { "$group": {
       "_id": {
           "customerId": "$_id.customerId",
           "day": "$_id.day"
       },
       "hours": { 
           "$push": { 
               "hour": "$_id.hour",
               "pings": "$pings",
               "links": "$links"
           }
       }
    }}
])

O truque é quando você $subtract um objeto de data de outro, você obtém o valor "época" de volta como resultado. Nesse caso, usamos a data de início "epoch" para obter todo o valor do carimbo de data e hora e apenas fornecemos a "data matemática" para corrigir os horários para os intervalos necessários. Então o resultado:
{
    "_id" : {
            "customerId" : 123,
            "day" : NumberLong("1419984000000")
    },
    "hours" : [
            {
                    "hour" : NumberLong("1420020000000"),
                    "pings" : 2,
                    "links" : 3
            }
    ]
}

O que pode ser mais palatável para você do que o que os operadores de data fornecem como resultado, dependendo de suas necessidades.

Você também pode adicionar um pequeno atalho para isso com o MongoDB 2.6 através do $let operador que permite declarar "variáveis" para operações com escopo:
db.event.aggregate([
    { "$group": {
        "_id": {
            "$let": {
                "vars": { 
                   "date": { "$subtract": [ "$startTime", new Date("1970-01-01") ] },
                   "day": 1000*60*60*24,
                   "hour": 1000*60*60
                },
                "in": {
                    "customerId": "$customerId",
                    "day": {
                        "$subtract": [
                            "$$date",
                            { "$mod": [ "$$date", "$$day" ] }
                         ]
                    },
                    "hour": {
                        "$subtract": [
                            "$$date",
                            { "$mod": [ "$$date", "$$hour" ] }
                         ]
                    }
                }
            }
        },
        "pings": { "$sum": "$ping" },
        "links": { "$sum": "$link" }
    }},
    { "$group": {
       "_id": {
           "customerId": "$_id.customerId",
           "day": "$_id.day"
       },
       "hours": { 
           "$push": { 
               "hour": "$_id.hour",
               "pings": "$pings",
               "links": "$links"
           }
       }
    }}
])

Também quase esqueci de mencionar que seus valores para "ping" e "link" são na verdade strings, a menos que seja um erro de digitação. Mas se não, certifique-se de convertê-los como números primeiro.