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como atualizar um objeto da coleção mLab usando _id


Você está usando updateOne deve ser updateMany do seguinte modo 
db.collection("home").updateMany(myquery, {

updateOne atualizará o primeiro documento.

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Veja também esta linha 
const myquery = {"_id": ObjectId }; is incomplete

Deveria estar 
const myquery = {"_id": ObjectId("some id") };