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Como implementar o mapa de hash baseado em disco usando o MongoDB-Java


Novamente, não sei como seu HashMultiMap vai funcionar, mas no MongoDB você basicamente armazena objetos em JSON (JSON binário aprimorado, tecnicamente falando).

Então seu documento pode ficar assim:
{
  key1: [value1, value2, value3, ...],
  key2: [value1, value2, value3, ...],
  ...
}

Se isso vai funcionar para você - ótimo.