Verifique se sua cópia do mongodump e o próprio banco de dados são da mesma versão.

Eu tive exatamente o mesmo problema (completo sem saída de terminal ou logs) quando tentei fazer um dump de um servidor mongo 3.2.4 com um cliente mongodump 2.4.1. A remoção do cliente mais antigo e a instalação do mais novo o resolveram imediatamente.