Desenvolvedor Bitnami aqui.

Você precisa copiar seus arquivos para o repositório remoto, criar os arquivos de configuração e depois incluir essa configuração na configuração do Apache para servir a aplicação. Parece que você fez a maior parte do trabalho, mas pode haver um erro em uma das etapas. Este guia irá ajudá-lo a configurar seu aplicativo para acessá-lo corretamente.

https://wiki.bitnami.com/Applications/Bitnami_Custom_Node.js_Application

Espero que ajude.

Jota