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Como calcular o percentil?


Ainda parece não haver uma maneira nativa de calcular percentis, mas combinando alguns operadores agregados, você pode obter o mesmo resultado.
db.items.aggregate([
        {'$group': {
            '_id': {
                'league': '$league',
                'base': '$base',
                'type': '$type'
            },
            'value': {'$push': '$chaosequiv'}
        }},
        {'$unwind': '$value'},
        {'$sort': {'value': 1}},
        {'$group': {'_id': '$_id', 'value': {'$push': '$value'}}},
        {'$project': {
            '_id': 1,
            'value': {'$arrayElemAt': ['$value', {'$floor': {'$multiply': [0.25, {'$size': '$value'}]}}]}
        }}
    ], allowDiskUse=True)

Note que eu escrevi meu código original em pymongo para um problema que precisava agrupar em 3 campos no primeiro grupo, então isso pode ser mais complexo do que o necessário para um único campo. Eu escreveria uma solução específica para essa pergunta, mas não acho que haja informações específicas suficientes.