Este é o erro de falha em seu log.
Então eu acho que você tem alguns dados 3.4 em seu
/data/db . - Se você deseja uma instalação limpa, basta remover o conteúdo de
/data/dbe reiniciemongod
ou
- Consiga um mongod 3.4
Ref:https://docs.mongodb.com/manual/ release-notes/3.6-upgrade-standalone/