Você pode usar uma expressão regular em seu objeto de consulta para fazer isso:
// Select docs where at least one examples element contains an example value
// that's made up only of digits.
db.test.find({'examples.example': /^\d+$/})
// Select docs where at least one examples element contains an example value
// that's made up only of digits.
db.test.find({'examples.example': /^\d+$/})