Aqui está meu arquivo de configuração do MongoDB de teste simples para Windows. Observe que eu tinha que ter 2 espaços antes de cada propriedade, por exemplo, path. Quando eu tinha 3 espaços, recebi um erro na inicialização.
Eu inicio o servidor com:
mongod --config c:\tools\mongodb\db\mongod.cfg
systemLog:
destination: file
path: "C:\\tools\\mongodb\\db\\log\\mongo.log"
logAppend: true
storage:
dbPath: "C:\\tools\\mongodb\\db\\data"
security:
authorization: enabled