Então, aqui estão as alterações antes de começar a funcionar, removeu var Doc =e fechou o banco de dados somente após a função dentro de findOne() ser acionada, caso contrário, ele fecha o banco de dados antes do resultado.
var name = 'chrispy';
var pass = '';
console.log("About to check for name and pw");
Mongo.connect('mongodb://127.0.0.1:27017/main', function(err, db) {
if(err) throw err;
var collection = db.collection('users');
// does user exist
collection.findOne({name : name}, function(err,doc){
if(err) throw err;
if(doc)
console.log("Found: "+name+", pass="+doc.pass);
else
console.log("Not found: "+name);
db.close();
});
});