Não há modo de memória para o MongoDB. De acordo com este link, esse recurso não será incluído até pelo menos o MongoDB 2.8.

Embora, como está usando E/S mapeada em memória, deve ser tão rápido quanto na memória durante o processamento real. Não a inicialização embora.

Além disso, há um hack para usar a unidade de disco RAM e colocar seu mongo db lá. Assim ficaria inteiramente na memória.