Você pode usar qualquer banco de dados que quiser com o Meteor, mas perderá três dos sete benefícios principais do quadro:
Eu uso Redis e Postgres com Meteor, além do MongoDB. Eu uso Meteor Methods para expor funções no cliente para criar, ler, atualizar e excluir registros em outros bancos de dados.
O suporte oficial para Redis e outros bancos de dados está no roteiro do Meteor , atualmente direcionado para a versão 1.1. O Meteor está atualmente na versão 0.7.0.1, então isso provavelmente não acontecerá em breve.
Se você deseja integrar outro armazenamento de dados como o Cassandra com mais força ao Meteor, provavelmente começaria com o mongo-livedata módulo.