Você pode criar o índice com o shell do mongo, mas se quiser fazer isso por meio de código e já que está usando spring-data-mongodb, use isto:
mongoTemplate.indexOps(B.class).ensureIndex(new Index().on("a", Order.ASCENDING)); Você também pode especificar o nome da coleção se o nome da sua classe não corresponder a ele:
mongoTemplate.indexOps("b").ensureIndex(new Index().on("a", Order.ASCENDING));
