Ao invés de usar:
mongoimport -d DATABASE_NAME -c COLLECTION_NAME --file YOUR_JSON_FILE
use o seguinte comando:
mongoimport -d DATABASE_NAME -c COLLECTION_NAME --file YOUR_JSON_FILE --jsonArray
mongoimport -d DATABASE_NAME -c COLLECTION_NAME --file YOUR_JSON_FILE
mongoimport -d DATABASE_NAME -c COLLECTION_NAME --file YOUR_JSON_FILE --jsonArray