MongoDB
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mongodb adiciona contador a cada documento recuperado


Embora a resposta mencionada por @prasad_ pareça funcionar, $ unwind tem desde o Mongodb 3.2 a opção includeArrayIndex que facilita a obtenção:
db.collection.aggregate([
  {
    $group: {
      _id: null,
      data: {
        $push: "$$ROOT"
      }
    }
  },
  {
    $unwind: {
      path: "$data",
      includeArrayIndex: "counter",

    }
  },
  {
    $replaceRoot: {
      newRoot: {
        $mergeObjects: [
          "$data",
          {
            counter: {
              $add: [
                "$counter",
                1
              ]
            }
          }
        ]
      }
    }
  }
])

O último estágio está aqui apenas para reformular seus documentos e adicionar 1 a cada contador, pois é baseado em 0 (com base no índice do array)

Você pode testá-lo aqui.