Tivemos algo muito semelhante, movemos um programa de SO de 32 bits para 64 bits e vários processos simultâneos lançariam o erro de E/S:Redefinição de conexão.
Tropecei nisso que corrigiu:
https://community.oracle.com/message/3701989
Basicamente, adicione o parâmetro -Djava.security.egd=file:/dev/./urandom e pronto :)