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Atualize a declaração usando vb.net para atualizar todos os campos


As variáveis ​​de ligação em você UPDATE declaração deve ser prefixada por dois pontos, não o @ símbolo
    cmd.CommandText = "update tablenodes set nodeName=:NodeName, centerX = :NodeCenterX," & _
       "centerY=  :NodeCenterY , radius=  :NodeRadius where nodeNo= :nodeNum and fileno= :FileNum"

E não haveria prefixo no que você está definindo os parâmetros
    cmd.Parameters.Add("NodeNum", OracleDbType.Int32).Value = nd.pID
    cmd.Parameters.Add("NodeName", OracleDbType.Varchar2).Value = nd.pName
    cmd.Parameters.Add("NodeCenterX", OracleDbType.Int32).Value = nd.pCenter.X
    cmd.Parameters.Add("NodeCenterY", OracleDbType.Int32).Value = nd.pCenter.Y
    cmd.Parameters.Add("NodeRadius", OracleDbType.Double).Value = nd.pRadius
    cmd.Parameters.Add("FileNum", OracleDbType.Int32).Value = FN