Otimização de uma consulta oracle

Primeiro, não há necessidade de distinct . A consulta pode ser escrita como:

select * 
  from example@sqldat.com 
 where column1 in (
          select column2 
            from example@sqldat.com 
           where column3 > 0
                  ) 
order by column1

Segundo, existem (pelo menos) mais duas maneiras de escrevê-lo. Ou com JOIN :

select t1.* 
  from example@sqldat.com t1
  join example@sqldat.com t2
 where t2.column2 = t1.column1
   and t2.column3 > 0 
group by
       t1.id, t1.column1, ... 

order by t1.column1

ou (minha preferência) com EXISTS :

select t1.* 
  from example@sqldat.com t1 
 where exists
       ( select *
           from example@sqldat.com 
          where t2.column2 = t1.column1
            and t2.column3 > 0
                  ) 
order by column1

De qualquer forma, você deve verificar os planos de execução de todos eles.

Espero que o desempenho seja melhor se você tiver um índice em table1.column1 e para table2 , ou um índice em column2 ou um índice composto em (column3, column2)