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Como encontrar o nome da cidade não começando e terminando com uma vogal


Sua primeira consulta estaria correta se você usasse AND em vez de OR .

Você pode achar a lógica mais simples como:
where not (city like 'A%' or city like 'E%' or . . . ) and
      . . . 

Pelas regras da lógica, isso é equivalente a:
where city not like 'A%' and city not like 'E%' and . . . ) and
      . . . 

Quanto à expressão regular, ela tem apenas a comparação no início da string:
where not regexp_like(lower(city), '^[aeiou].*[aeiou]$')