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Como obter o nível de hierarquia desta consulta


Você precisa adicionar uma coluna chamada Level (ou como você quiser chamá-lo) - tanto para o SELECT "âncora" quanto para a parte recursiva do seu CTE - assim:
WITH CategoryRec AS 
(
    SELECT Id, Parentid, Name, 1 AS 'Level'
    FROM dbo.Category

    UNION ALL

    SELECT cr.Id, c.Parentid, cr.Name, cr.Level + 1 
    FROM CategoryRec AS cr 
    INNER JOIN dbo.Category AS c ON cr.Parentid = c.Id
    WHERE c.Parentid IS NOT NULL
)
SELECT DISTINCT Id, Parentid, Name, Level
FROM  CategoryRec