Uma maneira direta de fazer isso é usar uma subconsulta correlacionada em
CROSS APPLY . Se sua mesa for mais ou menos grande, sua próxima pergunta será como torná-la mais rápida. Índice em
PlaceB, Product, PickTime INCLUDE (Qty) deve ajudar. Mas, se sua tabela for muito grande, o cursor seria melhor. WITH
ADVPICK
AS
(
SELECT 'A' as PlaceA,PlaceB, case when PickTime = '00:00' then '07:00' else isnull(picktime,'12:00') end as picktime, cast(Product as int) as product, Prd_Description, -Qty AS Qty FROM t_pick_orders
UNION ALL
SELECT 'A' as PlaceA,PlaceB, '0', cast(Code as int) as product, NULL, Stock FROM t_pick_stock
)
,stock_post_order
AS
(
SELECT
*
FROM
ADVPICK AS Main
CROSS APPLY
(
SELECT SUM(Sub.Qty) AS new_qty
FROM ADVPICK AS Sub
WHERE
Sub.PlaceB = Main.PlaceB
AND Sub.Product = Main.Product
AND T.PickTime <= Main.PickTime
) AS A
)
SELECT
*,
CASE WHEN new_qty > qty THEN new_qty ELSE qty END AS order_shortfall
FROM
stock_post_order
WHERE
new_qty < 0
ORDER BY PlaceB, picktime, product;
Ah, e se
(PlaceB, Product, PickTime) não é único, você obterá resultados um pouco diferentes da consulta original com SUM() OVER . Se você precisar exatamente dos mesmos resultados, precisará usar alguma coluna extra (como ID ) para resolver os empates. 
