Tenho a forte sensação de que tem a ver com o ApplicationName propriedade. Acho que você precisa definir o ApplicationName para provedores de associação, funções e perfis.

Acho que este artigo fala sobre o problema que você está enfrentando ...

http://weblogs.asp.net/scottgu/archive/2006/04/22/Always-set-the-_2200_applicationName_2200_-property-when-configuring-ASP.NET -2.0-Membership-and-other-Providers.aspx