Há um bom post aqui que detalha uma maneira de fazer isso.
Você precisará usar um ConnectionManager e definir a propriedade ConnectionString de um pacote de configuração.
A propriedade ConnectionString é uma string de conexão de banco de dados totalmente qualificada, como
Data Source=localhost;Initial Catalog=SSISConfig;Provider=SQLNCLI.1;Integrated Security=SSPI;Auto Translate=False;
Existem algumas pegadinhas e aborrecimentos com o uso de pacotes de configuração, então você pode ter que mexer um pouco. Eu seria mais detalhado, mas faz cerca de um ano desde a última vez que trabalhei em um projeto SSIS.
Se você tiver algum problema específico, por favor, volte e comente sobre o que você acertou. Vou tentar reacender as memórias antigas.
