Da documentação do pyodbc
Para chamar um procedimento armazenado agora, passe a chamada para o método execute usando um formato que seu banco de dados reconhece ou usando o formato de escape de chamada ODBC. (O driver ODBC irá reformatar a chamada para que você corresponda ao banco de dados fornecido.)
Para o SQL Server, você usaria algo assim:
# SQL Server format
cursor.execute("exec sp_dosomething(123, 'abc')")
# ODBC format
cursor.execute("{call sp_dosomething(123, 'abc')}")
Então, para chamar seu procedimento
id_ = 'test'
pw = '12345'
depart = 'none'
class_ = 'GM'
name = 'name'
birthday = 'None'
grade = 3
subgrade = 2
sql = 'exec [my_database].[dbo].[my_table](?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?)'
values = (id_, pw, depart, class_, name, birthday, grade, subgrade)
cursor.execute(sql, (values))
