Mysql
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Pule certas tabelas com mysqldump


Você pode usar o --ignore-table opção. Então você poderia fazer
mysqldump -u USERNAME -pPASSWORD DATABASE --ignore-table=DATABASE.table1 > database.sql

Não há espaço em branco após -p (isso não é um erro de digitação).

Para ignorar várias tabelas, use esta opção várias vezes, isso está documentado para funcionar desde pelo menos versão 5.0 .

Se você quiser uma maneira alternativa de ignorar várias tabelas, você pode usar um script como este:
#!/bin/bash
PASSWORD=XXXXXX
HOST=XXXXXX
USER=XXXXXX
DATABASE=databasename
DB_FILE=dump.sql
EXCLUDED_TABLES=(
table1
table2
table3
table4
tableN   
)
 
IGNORED_TABLES_STRING=''
for TABLE in "${EXCLUDED_TABLES[@]}"
do :
   IGNORED_TABLES_STRING+=" --ignore-table=${DATABASE}.${TABLE}"
done

echo "Dump structure"
mysqldump --host=${HOST} --user=${USER} --password=${PASSWORD} --single-transaction --no-data --routines ${DATABASE} > ${DB_FILE}

echo "Dump content"
mysqldump --host=${HOST} --user=${USER} --password=${PASSWORD} ${DATABASE} --no-create-info --skip-triggers ${IGNORED_TABLES_STRING} >> ${DB_FILE}