Estes são alguns passos que você pode fazer:
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Crie um context.xml e salve-o em TOMCAT_HOME/conf.
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No context.xml, você deve adicionar sua configuração de banco de dados, que pode se parecer com:
<Resource name="jdbc/test" auth="Container" type="javax.sql.DataSource" maxActive="510" minIdle="0" maxIdle="200" maxWait="10000" username="test" password="test" driverClassName="com.mysql.jdbc.Driver" url="jdbc:mysql://127.0.0.1:3306/test" poolPreparedStatements="true" maxOpenPreparedStatements="510" validationQuery="SELECT 1" testOnBorrow="true" />
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No web.xml de sua aplicação consulte o contexto acima, como:
<resource-ref> <description>DB Connection</description> <res-ref-name>jdbc/test</res-ref-name> <res-type>javax.sql.DataSource</res-type> <res-auth>Container</res-auth> </resource-ref>
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Coloque o JAR (por exemplo, mysql-connector-java-5.1.12-bin.jar) contendo o driver mysql em TOMCAT_HOME/lib
Eu espero que isso ajude.