Bem, você pode tentar fazer um loop com um foreach nesse array. Então, digamos que você nomeou suas caixas de seleção como
name="checkbox[]" . Em seguida, na página onde você está processando o
$_POST vars você pode fazer $sql = "INSERT INTO table(column1,column2) VALUES (?,?)";
$stmt = $mysqli->prepare($sql);
foreach ($_POST['checkbox'] as $box) {
//process each checkbox here
$stmt->bind_param('ss', $box, $otherValue);
$stmt->execute();
}
Este é apenas um pseudo-código para você começar.
Você pode encontrar mais informações sobre declarações preparadas aqui:http://php .net/manual/en/mysqli-stmt.bind-param.php
