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substituir correspondência exata em php


Isso depende muito de como seus dados são formatados dentro de $r_val , mas um bom lugar para começar seria tentar:
$r_val = preg_replace('/(?<!\.)\b0\b(?!\.)/', '-', $r_val);

Onde \b é um caractere de comprimento 0 que representa o início ou o fim de uma 'palavra'.

Por mais estranho que possa parecer, mas a documentação de regex Perl é realmente muito bom para explicar a parte regex do preg_* funções, já que Perl é onde a funcionalidade é realmente implementada.