Eu posso lhe dar a idéia básica de como você pode fazer isso. Basta criar um link para cada linha que redirecionará o controle para delete.php(O arquivo que fará a exclusão.) O controle só será redirecionado caso seu usuário confirme a operação de exclusão. O link pode ser assim.
<a class="button" href="<?php echo base_url();?>delete.php/<?php echo $row->id;?>" onclick="javascript: return confirm('Are you SURE you wish to do this?');">Delete</a>
