Quando você se conecta a 127.0.0.1 , você se conecta ao sistema atual. Independentemente de qual sistema está sendo executado:main ou vm . Você deve definir as configurações de rede do VirtualBox para que vm pode se conectar ao seu sistema principal. Nesse caso, você se conectará de vm não para localhost, mas para o endereço IP que você definiu como principal OS .

Ou você pode configurar o MySQL para o vm e mova seu banco de dados para esse MySQL .

EDITAR

Para testar a conexão com MySQL você pode usar telnet (http://windows.microsoft.com/ pt-br/windows/telnet-faq#1TC=windows-7 ).Primeiro você deve conhecer o MySQL porta. Você pode obtê-lo em MySQL config ou tente as portas da resposta do @Prageeth Roshane. Então você deve tentar se conectar de VirtualBox para MySQL ao porto encontrado. Você pode usar ou programm ou telnet. Se você tiver problemas com conexões, tente verificar se o firewall na VM e no sistema operacional principal não está bloqueado em seu programa (ou telnet).

P.S. Se você pode se conectar ao MySQL de outro PC, mas não pode se conectar da VM, o problema está nas configurações de rede da VM.