Tente isto:
SHOW TABLES FROM database
WHERE Tables_in_database
LIKE 'wp_%' AND Tables_in_database
NOT REGEXP 'wp_[0-9]+'
ou seja, remova o
% personagem de regex. 
SHOW TABLES FROM database
WHERE Tables_in_database
LIKE 'wp_%' AND Tables_in_database
NOT REGEXP 'wp_[0-9]+'
% personagem de regex. 
