Mysql
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Tendo Timeout adquirindo uma conexão após atualizar o Knex


Você precisa destruir as conexões assim que a consulta for executada.
 var knex = new Knex(config)
  knex(table)
    .where({ id: 1 })
    .then((result) => {
      callback(output)
    })
    .catch((err) => {
      err.error = true
      callback(err)
    })
    .finally(() => {
      knex.destroy()
    })
})