Todas as opções no seu my.cnf precisam estar dentro de um "grupo" como:
[mysqld]
bind-address 127.0.0.1
O grupo neste exemplo é "mysqld". O grupo é nomeado por uma linha que precede as opções e o nome do grupo está entre colchetes.
Seu arquivo não tem nenhum identificador de grupo nomeado antes de você começar a dar opções.
Leia https://dev.mysql.com/doc/ refman/5.7/en/option-files.html para mais detalhes sobre como formatar arquivos de opções do MySQL.
