Primeira pergunta:
UPDATE exp_channel_data SET text_column = REPLACE(text_column, '\r\n', '<br />')
Se não substituir nada, use
'\n' em vez de '\r\n' . Segunda questão:
Você não pode fazer isso com uma consulta SQL, você precisa buscar esses dados em um script PHP, ou qualquer outra coisa que desejar, e realizar uma substituição de expressão regular (exemplo para PHP):
$new_str = preg_replace('#<(p|span)[^>]+>#', '<$1>', $old_string);
