Acho que você quer apenas agregação condicional, não subconsultas:
select Max(Counting) as Total, student, stdType,
sum(case when score = '3' then 1 else 0 end) as Score3,
sum(case when score = '4' then 1 else 0 end) as Score4
from #tempBWMSHonors3
group by student, stdType;
Nota:se a pontuação for um número e não uma string, você não deve usar aspas simples para a constante.