De MySQL Dev Page - Instruções genéricas , (tente isso na linha de comando ou no prompt do mysql)
MySQL 5.7.6 e posterior:
mysql> ALTER USER 'root'@'localhost' IDENTIFIED BY 'MyNewPass';
MySQL 5.7.6 e anteriores:
mysql> SET PASSWORD FOR 'root'@'localhost' = PASSWORD('MyNewPass');
Por favor, consulte a página de desenvolvimento para Opções Específicas da Plataforma.