Este é um script bash linux exemplo usando mdbtools para extração automática e importação de um arquivo mdb para mysql.
#!/bin/bash
MDBFILE="Data.mdb"
OPTIONS="-H -D %y-%m-%d"
mdb-export $OPTIONS $MDBFILE TableName_1 > output_1.txt
mdb-export $OPTIONS $MDBFILE TableName_2 > output_2.txt
mdb-export $OPTIONS $MDBFILE TableName_n > output_n.txt
MYSQLOPTIONS=' --fields-optionally-enclosed-by=" --fields-terminated-by=, -r '
mysqlimport $MYSQLOPTIONS -L -uuser -ppasword database output_1.txt
mysqlimport $MYSQLOPTIONS -L -uuser -ppasword database output_2.txt
mysqlimport $MYSQLOPTIONS -L -uuser -ppasword database output_n.txt
Você pode usar algumas outras opções do mysqlimport:--delete:para excluir dados anteriores da tabela de destino do mysql.--ignore:ignora duplicatas--replace:substitua se uma duplicata for encontrada
Não é uma solução do Windows, mas espero que ajude.
