Existem pelo menos algumas coisas conhecidas que causam esta mensagem:

• Espaço em disco insuficiente no tmpdir impediu a criação do tmpfile.
• Memória insuficiente para alocar sort_buffer_size.
• Alguém executou KILL no meio de uma classificação de arquivos.
• O servidor foi encerrado durante a classificação de algumas consultas.
• Uma transação foi revertida ou cancelada devido ao tempo limite de espera do bloqueio ou impasse.
• Erros inesperados, como tabela de origem ou até mesmo tabela tmp estava corrompida.
• Falha no processamento de uma subconsulta que também estava classificando.

Verifique isso e aposto que seu problema será resolvido.