Uma breve versão de como fazer isso (que é explicado principalmente em o link que postei acima ):

• Você precisa REVOKE o GLOBAL desse usuário privilégios - isso ocorre porque o sistema de privilégios do MySQL é de cima para baixo. Se eles tiverem um GLOBAL privilégio para SELECT então isso se aplica a todos de seus bancos de dados
• Você precisa GRANT os privilégios corretos nas que faz precisa acessar (você pode usar curingas para isso)

É importante observar que MySQL não tem nenhum conceito de privilégio "DENY" .