Engraçado porque copiar e colar "MySQL Connector/J" no Google me deu o código-fonte como o primeiro resultado.
Mas se você estiver procurando por código-fonte para um aplicativo gratuito, a maneira mais conveniente que encontrei é procurar o pacote relacionado no Ubuntu (ou Debian) e baixar o código-fonte relacionado.
Funciona melhor se você os estiver usando, você pode simplesmente usar o aptitude search / apt-get source combo para baixá-lo. Mas se você estiver usando outro sistema operacional, basta fazer uma pesquisa no Google como
site:packages.ubuntu.com mysql connector/j