Posso reproduzir seu erro se meu conjunto de caracteres de sessão for
binary :mysql [localhost] {msandbox} (test) > set names binary;
Query OK, 0 rows affected (0.00 sec)
mysql [localhost] {msandbox} (test) > insert into tracking_data (route, data, user_id) values ('route', '{"route": "value"}', 1);
ERROR 3144 (22032): Cannot create a JSON value from a string with CHARACTER SET 'binary'.
Então eu posso corrigi-lo definindo o conjunto de caracteres da sessão para corresponder à tabela:
mysql [localhost] {msandbox} (test) > set names utf8mb4;
Query OK, 0 rows affected (0.00 sec)
mysql [localhost] {msandbox} (test) > insert into tracking_data (route, data, user_id) values ('route', '{"route": "value"}', 1);
Query OK, 1 row affected (0.01 sec)
Portanto, concluo que você definiu o conjunto de caracteres da sessão para
binary . Execute
show session variables like 'char%'; e veja o que ele lhe diz. 
