Você deve vincular a sessão a um mecanismo SQLAlchemy, não diretamente a um objeto de conexão MySQLDb.
engine = create_engine("mysql://user:[email protected]/dbname")
Session.configure(bind=engine)
(Você pode remover seu
db1
variável.) Do tutorial:
Veja também https://docs.sqlalchemy.org/en/latest/orm /tutorial.html