Normalmente, os comentários são removidos antes que a instrução SQL seja registrada no log binário. No entanto, uma solução desagradável é fingir que o comentário ypur contém sintaxe para alguma versão futura do MySQL - por exemplo. 9.99.99:
/*!99999 user:jwilkie */ insert into tbl values (yyy);
Esses comentários serão então passados para o log binário.