Nomeie suas caixas de seleção assim:
<input type="checkbox" name="chk[]" value="1" />
<input type="checkbox" name="chk[]" value="2" />
e assim por diante, onde os valores são os ids da Tabela1. Quando o usuário clicar no botão enviar, o POST conterá os valores das caixas de seleção marcadas.
Em seu PHP, você tem então
$chkArr = isset($_POST['chk']) ? $_POST['chk'] : array();
$chkArrCSV = implode(',',$chkArr);
Então você pode construir sua consulta como
$sql = 'SELECT blah FROM blah WHERE id IN '.mysql_real_escape_string($chkArrCSV);
e o que mais você precisar para higienizar a entrada do usuário.
