Aumentando o
wait_timeout
e/ou interactive_timeout
deve ajudar. Primeiro verifique o valor atual:C:\> mysql -hlocalhost -uroot -proot
mysql> SHOW VARIABLES LIKE 'wait_timeout';
Se estiver muito baixo (por exemplo, 30 segundos), aumente (por exemplo, 5 minutos):
mysql> SET SESSION wait_timeout = 300;
mysql> SET SESSION interactive_timeout = 300;
Em seguida, execute seu arquivo SQL:
mysql> \. database.sql
