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ERRO:HHH000299:Não foi possível concluir a atualização do esquema java.lang.NullPointerException


Parece que você está misturando incorretamente dialetos e bancos de dados do Hibernate. Em sua edição original, você tem um banco de dados MySQL e um dialeto de org.hibernate.dialect.HSQLDialect (veja o primeiro bloco de código abaixo).

Na sua solução você tem o banco de dados MySQL e o dialeto correto de org.hibernate.dialect.MySQL5Dialect (veja o segundo bloco de código abaixo).

Se você alterou a databasePlatform no original para ser o dialeto MySQL, teria funcionado também.

Original:
<bean id="entityManagerFactory" class="org.springframework.orm.jpa.LocalContainerEntityManagerFactoryBean">
  ...
  <property name="jpaVendorAdapter">
    <bean class="org.springframework.orm.jpa.vendor.HibernateJpaVendorAdapter">
      ...
      <property name="databasePlatform" value="org.hibernate.dialect.HSQLDialect"/>
    </bean>
  </property>
  ...
</bean>

Trabalhando:
<persistence version="2.0" xmlns="http://java.sun.com/xml/ns/persistence"
  xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" 
  xsi:schemaLocation="http://java.sun.com/xml/ns/persistence http://java.sun.com/xml/ns/persistence/persistence_2_0.xsd">
  <persistence-unit name="WebAppPU" transaction-type="RESOURCE_LOCAL">
    ...
    <properties>
      ...
        <property name="hibernate.dialect" value="org.hibernate.dialect.MySQLDialect"/>      
      ...
    </properties>
  </persistence-unit>
</persistence>