Não tenho certeza se você está pedindo para fazer backup de procedimentos armazenados, bem como de todo o resto, ou apenas dos procedimentos armazenados por conta própria ...
Stored procedured no dump com todo o resto:
mysqldump -R <dbname> #or
mysqldump --routines <dbname>
Apenas os procedimentos armazenados:
mysqldump -n -t -d -R <dbname> #or
mysqldump --no-create-db --no-create-info --no-data --routines <dbname>
Isso ajuda?